转录组简介
转录组是特定物种、组织或细胞在特定生理状态下转录的所有RNA的集合,包括mRNA和非编码RNA( Non-coding RNA )。
转录组测序能够快速获得mRNA表达谱;根据测定的序列同时可以对SNP、可变剪接等转录本的序列及结构信息进行精确地分析。
此外,通过不同的文库构建策略,转录组测序能够发现大量的ncRNA,并且对其表达水平和转录本结构进行分析;
当进一步开展ncRNA与mRNA的关联分析时,就可以深入研究ncRNA的调控网络( ceRNA ) 。
ceRNA ( competing endogenous RNA )是由美国哈佛大学医学院的研究小组于2011年在《细胞》上提出的一项假说,
其核心内容∶具有相同miRNA应答元件(MiRNAResponse Element,MRE)的mRNA、假基因转录物、
IncRNA等转录物通过竞争性结合同种miRNA来调控各自的表达水平,从而影响细胞的功能。
近年来多项研究已证实了该假说的真实性。
所以,ceRNA并不是一类RNA分子,而是一个假说,一种调控机制。
第一节:转录组测序在医学方向的研究应用【三味教育】.mp4
第二节:医学方向mRNA测序数据挖掘策略【三味教育】.mp4
第三节:医学方向ncRNA测序数据挖掘的策略【三味教育】.mp4
第四节:转录组技术在代谢类疾病研究中的应【三味教育】 .flv
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