临床医学生信分析生物信息TCGA GEO Oncnmine数据挖掘视频教程讲解目录


相对对数表达(RLE)

一个探针组在某个样品的表达值除以该探针组在所有样品中表达之的中位数后取对数

反映平行实验的一致性

相对标准差(NUSE)

一个探针组在某个样品的PM值的标准差除以该探针组在各样品中的PM值标准差的中位数后取对数。

反映平行实验的一致性比RLE更为敏感。


3GEO数据下载和数据质量分析【三味教育】.mp4

5寻找差异基因及制作热图和火山图【三味教育】.mp4

6富集分析【三味教育】.mp4

9TCGA数据下裁【三味教育】.mp4

1OTCGA数据整理和基因注释【三味教育】.mp4

课时1数据挖掘概述【三味教育】.mp4

课时2GEO在线工具的应用【三味教育】.mp4

课时4原始数据预处理【三味教育】.mp4

课时7KEGG分析【三味教育】.mp4

课时8蛋白互作网络【三味教育】.mp4

课时11寻找差异基因和制作5年生存率【三味教育】.mp4

课时12Oncomine概述及Meta分析【三味教育】.mp4

课时13Oncomine之差异分析及共表达分析【三味教育].mp4

数据挖掘代码【三味教育】.zip


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