生信分析GEO分析高级教程多芯片联合分析视频课程讲解目录
表达谱芯片数据分析(进阶版)
主要内容
从GEO下载数据
归一化
差异表达
火山图
热图
1、转录组分析
包含mRNA、miRNA、IncRNA、cricRNA在内的全转录组测序数据皆可分析。
既可单独分析(Hub基因思路等)。也可组合分析(ceRNA网络思路等)
2、表观遗传组分析
此部分主要包含DNA甲基化与RNA甲基化(m6A)甲基化等核酸修饰类型。
主要分析在不同修饰的条件下对基因表达的影响。
3、代谢组学分析
对生物体内所有代谢物进行定量分析。并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系。
多用于包含糖尿病、肥胖症、代谢综合症、肿瘤等与代谢相关疾病的研究
4、宏基因组学分析
它通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA.构建宏基因组文库。
利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能。最终与疾病进行关联。
5.基因组学、全外显子组(TMB、SNP、CNV等)、蛋白组学、多组学联合分析等。
01.data【三味教育】
02.diff【三味教育】
03.heatmap【三味教育】
04.annotate【三味教育】
geoArray.ppt【三味教育】 .pdf
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GEO高级课程资料_代码【三味教育】.7z
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