生信分析GEO数据库肿瘤微环境视频教程数据挖掘零基础入门生信分析教程视频网课程

生信分析GEO数据库肿瘤微环境视频教程讲解目录

课程内容

简介

数据下载

数据整理

肿瘤微环境分析(免疫和基质评分)

临床数据整理

评分和生存的关系

评分和临床性状的关系

基质细胞分组差异分析和热图

免疫细胞分组差异分析和热图

GO富集分析

KEGG富集分析

蛋白互作网络分析

基因生存分析

肿瘤微环境

肿瘤微环境是肿瘤细胞所处的细胞环境，其组成包括细胞外基质、可溶性分子和肿瘤基质细胞。

肿瘤微环境一旦形成，众多免疫细胞，如T细胞、髓源抑制性细胞，巨噬细胞等，都被趋化至此，构成肿瘤的微环境。

在肿瘤微环境中，免疫细胞和基质细胞是两种主要类型的非肿瘤组分，

并且已被提出对于肿瘤的诊断和预后评估是有价值的。

01.GEO数据库肿瘤微环境简介【三味教育】.mp4

02.软件准备【三味教育】.mp4

03.GEO数据下裁【三味教育】.mp4

04.GEO数据注释【三味教育】.mp4

05.肿瘤微环境【三味教育].mp4

06.肿瘤微环境评分和生存数据合并【三味教育】.mp4

07.肿瘤微环境评分和生存关系【三味教育】.mp4

08.肿瘤微环境评分和临床数据合并【三味教育】.mp4

09.肿瘤微环境评分和临床相关性分析【三味教育】.mp4

10.基质细胞分组差异分析【三味教育】.mp4

11.免疫细胞分组差异分析【三味教育】.mp4

12肿瘤微环境差异交集【三味教育】.mp4

13.基因名转换为基因id【三味教育】.mp4

14.GO富集分析【三味教育】.mp4

15.KEGG富集分析【三味教育】.mp4

16.蛋白互作网络构建【三味教育】.mp4

17.蛋白互作网络核心基因【三味教育】.mp4

18.批量化生存分析输入文件准备【三味教育】.mp4

19.批量化生存分析【三味教育】.mp4

geoEstimate微环境资料【三味教育】.rar

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