生信分析数据挖掘GEO甲基化免疫浸润视频教程讲解目录
甲基化免疫细胞浸润模式
主要内容
简介
数据下载
数据整理
基因甲基化程度差异分析
差异热图
数据矫正
EpiDISH
柱状图
热图
相关性热图
小提琴图
主成分分析
甲基化芯片
lllumina Human Methylation 450K BeadChip芯片可检测人全基因组近450,000个甲基化位点,具有单碱基的分辨率。
全面覆盖了96%的CpG岛,并根据需求加入了CpG岛以外的CpG位点、人类干细胞非CpG甲基化位点、
正常组织与肿瘤(多种癌症)组织差异甲基化位点、编码区以外的CpG岛、
miRNA启动子区域和GWAS疾病相关区域的位点,同时覆盖了HumanMethylation27 BeadChip的90%的位点。
免疫细胞浸润
免疫细胞浸润是指免疫细胞从血液中移向组织,开始发挥它的作用,可以从组织中分离出的浸润免疫细胞。
肿瘤中免疫细胞的浸润与临床结果密切相关,肿瘤中浸润的免疫细胞最有可能作为药物靶标来提高患者的生存率。
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