生信分析数据挖掘GEO甲基化免疫浸润视频教程讲解目录


甲基化免疫细胞浸润模式

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简介

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数据整理

基因甲基化程度差异分析

差异热图

数据矫正

EpiDISH

柱状图

热图

相关性热图

小提琴图

主成分分析

甲基化芯片

lllumina Human Methylation 450K BeadChip芯片可检测人全基因组近450,000个甲基化位点,具有单碱基的分辨率。

全面覆盖了96%的CpG岛,并根据需求加入了CpG岛以外的CpG位点、人类干细胞非CpG甲基化位点、

正常组织与肿瘤(多种癌症)组织差异甲基化位点、编码区以外的CpG岛、

miRNA启动子区域和GWAS疾病相关区域的位点,同时覆盖了HumanMethylation27 BeadChip的90%的位点。

免疫细胞浸润

免疫细胞浸润是指免疫细胞从血液中移向组织,开始发挥它的作用,可以从组织中分离出的浸润免疫细胞。

肿瘤中免疫细胞的浸润与临床结果密切相关,肿瘤中浸润的免疫细胞最有可能作为药物靶标来提高患者的生存率。


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