生信分析GEO数据库miRNA芯片数据挖掘文章套路视频教程Oncomine数据挖掘零基础入门生信分析教程视频网课程

生信分析GEO数据库miRNA芯片数据挖掘文章套路视频教程讲解目录

主要内容

简介

miRNA数据下载miRNA数据整理

miRNA差异分析、热图、火山图

miRNA转录因子预测

miRNA的GO富集分析

miRNA靶基因预测

mRNA数据下载mRNA数据整理

mRNA差异分析、热图、火山图

miRNA靶基因和差异mRNA取交集

调控网络构建

GO和KEGG富集分析

miRNA

 microRNA (miRNA）是一类能够调节基因表达的短单链内源非编码RNA(约22nt)，

通过与互补的mRNA选择性地结合抑制蛋白的产生，广泛存在于动物、植物、病毒等多种有机体中。

miRNA命名规则

命名包含三部分内容，即物种，microRNA类别，序号。三者间用短线连接。

1.物种一般用三个小写字母表示，如hsa,mmu和rno分别代表人，小鼠和大鼠。

2.MicroRNA类别是指所命名的microRNA是pre-miRNA还是mature miRNA。

pre-miRNA用mir表示,mature miRNA用miR表示。

3.序号为一阿拉伯数字，代表microRNA发现的先后。一般而言，数字越小，发现越早。

位于基因组不同部位但产生同样的mature miRNA的pre-miRNA在序号后添加短线和阿拉伯数字以示区别，

如hsa-mir-7-1, hsa-mir-7-2, hsa-mir-7-3。

有些pre-miRNA可以产生两个mature miRNA。对应pre-miRNA茎环结构5'和3'序列的mature miRNA分别加后缀-5p和-3p以示区分，

如hsa-miR-769-5p和hsa-miR-769-3p。

01 miRNA芯片数据挖掘简介【三味教育】.mp4

02 miRNA芯片数据下载【三味教育].mp4

03 miRNAid转换【三味教育】.mp4

04 miRNA数据分组【三味教育】.mp4

05 miRNA差异分析【三味教育】.mp4

06 miRNA转录因子富集分析【三味教育】.mp4

07 miRNA的GO富集分析【三味教育】.mp4

08 miRNA靶基因预测【三味教育】.mp4

09 mRNA芯片数据下裁【三味教育】.mp4

10 mRNAid转换【三味教育】.mp4

11 mRNA数据分组【三味教育】.mp4

12 mRNA差异分析【三味教育】.mp4

13靶基因和差异mRNA取交集【三味教育】.mp4

14 miRNA和mRNA调控网络【三味教育】.mp4

15基因名字转换基因id【三味教育】.mp4

16 Go富集分析【三味教育】.mp4

17 GO圈图绘制【三味教育】.mp4

18 KEGG富集分析【三味教育】.mp4

19 KEGG圈图绘制【三味教育】.mp4

74GEO_miRNA【三味教育】.rar

生信分析GEO数据库miRNA芯片数据挖掘文章套路视频教程截图