生信分析TCGA数据库下载差异分析生存分析视频教程讲解目录
课程主要内容
TCGA数据库简介
下载整理TCGA数据
差异表达
共表达网络
生存分析
什么是TCGA?
美国政府发起的癌症和肿瘤基因图谱(Cancer, Genome Atlas,..TCGA)计划,
试图通过应用基因组芬析技术,特别是采用夭规模的基因组测序,
蒋丁类全部癌症て近期自标为50种包括亚型在丙的肿瘤)的基因组变宾图谱绘制出莱,并进行系统分析,
盲在找到所有致癌和抑癌基因的微小变异,了解癌细胞发生、发展的机制,
在此基础上取得新的诊断和治疗方法,最后司以勾画出整个新型“预防癌症的策略”。
TCGA使命:提高人们对癌症发病分子基础的科学认识及提高我们诊断、治疗和预防癌症的能方
TCGA目标:完成一套完整的与所有癌症基因组改变相关的“图谱”。
章节1-TCGA数据库数据下载整理【三味教育】
TCGA01--数据库简介.ve【三味教育】.mp4
TCGAO2--网页下载数据.vc【三味教育】.mp4
TCGA03--命令行下载数据.vc【三味教育】.mp4
TCGA04--生成矩阵.vc【三味教育】.mp4
TCGA05--id转换成基因名.vc【三味教育】.mp4
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章节2-TCGA数据库GENE差异表达分析【三味教育】
TCGAO6--差异表达介绍.vc【三味教育】.mp4
TCGA07--edgeR差异表达.ve【三味教育】.mp4
TCGA08--DESeq差异表达.vc【三味教育】.mp4
章节3-TCGA数据库miRNA差异表达【三味教育】
TCGA09--miRNA数据下载与整理.vc【三味教育】.mp4
TCGA10--miRNA差异表达.vc【三味教育】.mp4
章节4-TCGA数据库共表达分析【三味教育】
TCGA11--共表达数据合并.vc【三味教育】.mp4
TCGA12--WGCNA.ve【三味教育】.mp4
章节5-TCGA数据做生存分析【三味教育】
TCGA13--生存分析介绍.vc【三味教育】.mp4
TCGA14--生存分析数据准备.vc【三味教育】.mp4
TCGA15--R做生存分析.vc【三味教育】.mp4
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