生信分析数据挖掘TCGA数据库肿瘤微环境视频教程免疫细胞分组差异分析KEGG富集分析生物信息学课程

生信分析数据挖掘TCGA数据库肿瘤微环境视频教程讲解目录

主要内容

简介

表达数据下载

数据整理

肿瘤微环境分析(免疫和基质评分)

临床数据下载和整理

评分和生存关系

评分和临床性状关系

差异分析

差异热图

GO富集分析

KEGG富集分析

基因生存分析

蛋白互作网络分析

肿瘤微环境

肿瘤微环境是肿瘤细胞所处的细胞环境，其组成包括细胞外基质、可溶性分子和肿瘤基质细胞。

肿瘤微环境一旦形成，众多免疫细胞，如T细胞、髓源抑制性细胞，巨噬细胞等，都被趋化至此，构成肿瘤的微环境。

在肿瘤微环境中，免疫细胞和基质细胞是两种主要类型的非肿瘤组分，并且已被提出对于肿瘤的诊断和预后评估具有价值的。

01肿瘤微环境简介【三味教育】.mp4

02表达数据下裁【三味教育】.mp4

03数据整理成表达矩阵【三味教育】.mp4

04 id转换成基因名【三味教育】.mp4

05肿瘤微环境细胞score【三味教育】.mp4

06临床数据下载【三味教育】.mp4

07临床数据提取【三味教育】.mp4

08评分和生存关系第一部分【三味教育】.mp4

09评分和生存关系第二部分【三味教育】.mp4

10评分和临床关系第一部分【三味教育】.mp4

11评分和临床关系第二部分【三味教育】.mp4

12基质细胞分组差异分析【三味教育】.mp4

13基质细胞分组热图绘制【三味教育】.mp4

14免疫细胞分组差异分析【三味教育】.mp4

15免疫细胞分组热图绘制【三味教育】.mp4

16差异交集和Venny图绘制【三味教育】.mp4

17基因名称转换成基因id【三味教育】.mp4

18 GO富集分析【三味教育】.mp4

19 KEGG富集分析【三味教育】.mp4

20蛋白互作网络构建【三味教育】.mp4

21蛋白互作网络构建第二部分【三味教育】.mp4

22批量化生存分析文件准备【三味教育】.mp4

23批量化生存分析【三味教育】.mp4

TCGA肿瘤微环境【三味教育】.zip

生信分析数据挖掘TCGA数据库肿瘤微环境视频教程截图