生信分析数据挖掘GTEx联合TCGA数据分析视频教程​GO富集分析热图绘制课程

生信分析数据挖掘GTEx联合TCGA数据分析视频教程讲解目录

GTEx联合TCGA数据挖掘

主要内容

简介

数据下载

ld转换

解剖图绘制

箱形图绘制

TCGA数据整理

GTEx和TCGA数据合并

差异分析

热图绘制

批量化生存分析

GO富集分析和圈图

KEGG富集分析和圈图

GTEx数据库

网易云

GTEx (Genotype-Tissue Expression,基因型-组织表达)数据库，研究从来自449名生前健康的人类捐献者的7000多份

尸检样本，涵盖44个组织(42种不同的组织类型)，包括31个实体器官组织、10个脑分区、全血、

2个来自捐献者血液和皮肤的细胞系，作者利用这些样本研究基因表达在不同组织和个体中有何差异。

GTEx对几乎所有转录基因的基因表达模式进行观察，而够确定基因组中影响基因表达的特定区域。

课时1GTEx数据库简介【三味教育】.mp4

课时2GTEx和TCGA数据下载【三味教育】.mp4

课时3GTEx数据ID转换【三味教育】 .mp4

课时4统计各个器官表达量【三味教育】.mp4

课时5解剖图绘制【三味教育】.mp4

课时6箱体图绘制【三味教育】.mp4

课时7提取GETx对应组织表达【三味教育】.mp4

课时8TCGA数据库分组【三味教育】.mp4

课时9TCGA数据库ID转换【三味教育】.mp4

课时10GTEx和TCGA数据合并【三味教育】.mp4

课时11差异基因表达【三味教育】.mp4

课时12热图绘制【三味教育】.mp4

课时13生存分析输入文件准备【三味教育】.mp4

课时14批量化生存分析【三味教育】.mp4

课时15基因名字转换为基因ID【三味教育】 .mp4

课时16GO富集分析【三味教育】.mp4

课时17GO圈图绘制【三味教育】.mp4

课时18KEGG富集分析【三味教育】.mp4

课时19KEGG圈图绘制【三味教育】.mp4

生信分析数据挖掘GTEx联合TCGA数据分析视频教程截图