生信分析数据挖掘GTEx联合TCGA数据分析视频教程讲解目录
GTEx联合TCGA数据挖掘
主要内容
简介
数据下载
ld转换
解剖图绘制
箱形图绘制
TCGA数据整理
GTEx和TCGA数据合并
差异分析
热图绘制
批量化生存分析
GO富集分析和圈图
KEGG富集分析和圈图
GTEx数据库
网易云
GTEx (Genotype-Tissue Expression,基因型-组织表达)数据库,研究从来自449名生前健康的人类捐献者的7000多份
尸检样本,涵盖44个组织(42种不同的组织类型),包括31个实体器官组织、10个脑分区、全血、
2个来自捐献者血液和皮肤的细胞系,作者利用这些样本研究基因表达在不同组织和个体中有何差异。
GTEx对几乎所有转录基因的基因表达模式进行观察,而够确定基因组中影响基因表达的特定区域。
课时1GTEx数据库简介【三味教育】.mp4
课时2GTEx和TCGA数据下载【三味教育】.mp4
课时3GTEx数据ID转换【三味教育】 .mp4
课时4统计各个器官表达量【三味教育】.mp4
课时5解剖图绘制【三味教育】.mp4
课时6箱体图绘制【三味教育】.mp4
课时7提取GETx对应组织表达【三味教育】.mp4
课时8TCGA数据库分组【三味教育】.mp4
课时9TCGA数据库ID转换【三味教育】.mp4
课时10GTEx和TCGA数据合并【三味教育】.mp4
课时11差异基因表达【三味教育】.mp4
课时12热图绘制【三味教育】.mp4
课时13生存分析输入文件准备【三味教育】.mp4
课时14批量化生存分析【三味教育】.mp4
课时15基因名字转换为基因ID【三味教育】 .mp4
课时16GO富集分析【三味教育】.mp4
课时17GO圈图绘制【三味教育】.mp4
课时18KEGG富集分析【三味教育】.mp4
课时19KEGG圈图绘制【三味教育】.mp4
生信分析数据挖掘GTEx联合TCGA数据分析视频教程截图
| 生信分析数据挖掘GTEx联合TCGA数据分析视频教程 百度网盘 课程大小:0.00字节 |
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