生信分析数据挖掘TCGA数据库CNV拷贝数变异分析生信自学网视频课程CNV圈图绘制GO富集分析课程

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TCGA数据库拷贝数变异

copy number variant

主要内容

简介

数据下载

基因注释

整理数据

正常组和癌症组差异比较

绘制CNV圈图

CNV和表达相关性分析

GO富集分析

KEGG富集分析

拷贝数变异

CNV (copy number variant）是指拷贝数目变异，是一个大小介于1kb至3MB的DNA片段的变异，

在人类基因组中广泛分布，极大地丰富了基因组遗传变异的多样性。

人类通常携带基因的两个拷贝----一个来自母亲，另一个来自父亲。

不过，数量也可能不是二，这就被称为拷贝数变异(CNV)。

在DNA复制的过程中，基因可能丢失或重复，从而改变其数量。

基因拷贝数的增加或减少其编码的蛋白质。

01_CNV简介【三味教育】.mp4

02_数据下裁【三味教育】.mp4

03_基因注释【三味教育】.mp4

04_数据整理合并【三味教育】.mp4

05_卡方检验输入文件准备【三味教育】.mp4

06_正常和癌症的CNV差异【三味教育】.mp4

07_圈图输入文件准备【三味教育】.mp4

o8_CNV圈图绘制【三味教育】 .mp4

09_提取差异基因的CNV矩阵【三味教育】.mp4

10_差异CNV基因和表达数据合并【三味教育】.mp4

11_CNV和表达水平的相关性检验【三味教育】.mp4

12_CNV和表达水平的可视化【三味教育】.mp4

13_基因名字转换成ID【三味教育】.mp4

14_GO富集分析【三味教育】.mp4

15_KEGG通路富集分析【三味教育】.mp4

48tcgaCNV资料【三味教育】.zip

ann【三味教育】 .pl

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