生信分析数据挖掘TCGA数据库TCGA基因差异表达分析转录因子调控网络视频教程

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TCGA基因差异表达分析

转录因子调控网络

转录因子

转录因尔(tranicription factor)是一群能与基因5'端上游特定序列专一性结合，

从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子。

转录因子的结合位点(transcriptiop factor binding site，TFBS）是转录因子调节基因表达时，

与基因模板链结合的区域。按照常识，转录因子(transcription factor)的结合位点一般应该分布在基因的前端。

课程内容

简介

TCGA数据下载

TCGA命令行下载

TCGA数据整理

TCGA的id转换

mRNA提取

mRNA差异表达

lncRNA提取

IncRNA差异表达

转录因子富集分析

转录因子数据整理

cytoscape下载和安装

cytoscape构建转录因子调控网络

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TCGA转录因子【三味教育】.zip

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