生信分析数据挖掘医学表观组ChIP-seq数据挖掘视频教程讲解目录
chip-seq信息分析
chip-seq
染色质免疫共沉淀技术
(Chromatin Immunoprecipitation,ChlP)也称结合位点分析法,
是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。
Chip-seq将ChlP与第二代测序技术相结合的ChlP-Seq技术,
能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。
主要内容
数据库准备和下载原始数据
质控
比对
peak finding
peak可视化
peak注释
motif discovery
chip-seq1(简介、质控和比对)【三味教育】.mp4
chip-seq2(查看peak、motif、 peak注释)【三味教育】.mp4
chip-seq信息分析(生信自学网)更新地址【三味教育】.txt
chip-seq【三味教育】 .pdf
command【三味教育】.sh
hist【三味教育】.R
peakView【三味教育】 .R
pie【三味教育】.R
removeN
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