生信分析数据挖掘GO富集分析视频教程讲解目录


GO富集

Go ( Gene ontology)按照生物途径(Biology

Process),分子功能( Molecular Function)和细胞定位(Cellular Location)对基因进行注释和分类。

通过对差异表达基因进行GO terms富集度统计学的分析,

计算出差异基因GO term的p-value和p-value的FDR值( q-value),

定位差异基因最可能相关的GOterm。

主要内容

>DAVID ( http://david.abcc.ncifcrf.gov/ )

BiNGO(cytoscape)

>非模式生物

图形化展示方式

该有向无环图为差

异基因GO富集分析的结果图形化展示方式,分支代表包含关系,

箭头方向从上之下所定义的功能范围越来越小,并通过包含关系,

将相关的GOTerm一起展示,颜色深浅代表富集中小程度,

越深富集水平越高,反之,则越低。


Go富集分析【三味教育】.mp4

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