生信分析数据挖掘GO富集分析视频教程讲解目录
GO富集
Go ( Gene ontology)按照生物途径(Biology
Process),分子功能( Molecular Function)和细胞定位(Cellular Location)对基因进行注释和分类。
通过对差异表达基因进行GO terms富集度统计学的分析,
计算出差异基因GO term的p-value和p-value的FDR值( q-value),
定位差异基因最可能相关的GOterm。
主要内容
>DAVID ( http://david.abcc.ncifcrf.gov/ )
BiNGO(cytoscape)
>非模式生物
图形化展示方式
该有向无环图为差
异基因GO富集分析的结果图形化展示方式,分支代表包含关系,
箭头方向从上之下所定义的功能范围越来越小,并通过包含关系,
将相关的GOTerm一起展示,颜色深浅代表富集中小程度,
越深富集水平越高,反之,则越低。
Go富集分析【三味教育】.mp4
goBarplot【三味教育】
goPvalue【三味教育】
chart_17AF86C7428E1435369166978【三味教育】.txt
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生信分析数据挖掘GO富集分析视频教程截图
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