生信分析数据挖掘GSEA基因富集分析教学视频课程讲解目录
GSEA富集分析
GSEA(Gene set enrichment analysis)根据已有的对基因的定位、功能、生物学意义等知识的基础上,
首先构建了一个分子标签数据库,数据库中包含了多个功能基因集。
通过分析基因表达数据,得到表达状况是否在某种功能上显著富集。
David和kobas等分析工具(先找差异基因)
. GSEA(无需先找差异基因)
GSEA计算的基本原理是扫描排序序列,当出现一个功能基因集中的基因时,
就增加ES值,反之,就减少ES值,所以在整个扫描过程中,ES是一个动态的值。
GSEA输入文件
表达数据集文件
表型数据文件
功能基因集文件
芯片注释文件
GSEA1_介绍.vb【三味教育】.mp4
GSEA2_数据和运行.vb【三味教育】.mp4
GSEA3_连续变量.vb【三味教育】.mp4
GSEA4_结果.vb【三味教育】.mp4
GSEA【三味教育].zip
生信分析数据挖掘GSEA基因富集分析教学视频课程截图
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