生信分析数据挖掘小RNA测序数据分析视频课程讲解目录
小RNA测序
小RNA是一类长度在18-30nt的RNA分子,卞要包拓miRNA、siRNA和piRNA。
小RNA能够调控基因的表达,在细胞的生长、发育、代谢等基础生物学过程中扮演着重要的角色。
通过高通量测序技术,可以发掘全基因组水平的小RNA图谱、
对miRNA表达水平定量、挖掘新的miRNA分子、预测靶基因、鉴定样品间差异表达分析。
主要内容
数据下载质控
reads长度分布统计
全基因组比对
己知lmiRNA鉴定》
Rfam数据库比对
差异表达
miRNA靶基因
新miRNA预测
其它分析
小rna测序1_质控和reads长度统计【三味教育】.mp4
小rna测序2_比对genome_miRNA_Rfam【三味教育】.mp4
小rna测序3_差异表达和靶基因【三味教育】.mp4
小rna测序4_新miRNA【三味教育】.mp4
小rna测序1_质控和reads长度统计
小rna测序2_比对genome_miRNA_Rfam
小rna测序3_差异表达和靶基因
小rna测序4_新miRNA
miRNACommand.txt
小RNA测序数据分析.ppt.pdf
barplot.R
DRR34.fastq
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