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表达谱芯片数据分析

主要内容

从GEO下载数据

归一化

差异表达

绘制火山图热图

数据下载

1.网页

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/2.bioconductor

R> library("GEOquery")

R> gse <-getGEO("GSE41804", GSEMatrix=T,

AnnotGPL=FALSE, destdir = "C:/Users/y/Desktop/GSE41804")

表达谱芯片数据分析【三味教育】.mp4

annotate【三味教育】

readCel【三味教育】

array 【三味教育】 .pdf

diffExp【三味教育】.xls

diffExpLevel【三味教育】.xls

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input【三味教育】.txt

inputData【三味教育】.txt

limma【三味教育】.R

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limma学习用【三味教育】.R

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