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CCLE数据库
CCLE (Cancer Cell Line Encyclopedia),是Broad研究所与诺华研究基金会联合开发的在线数据库,
界面很简洁,直接输入你想查的Genes或者细胞系,就可以得到想要的信息。
CCLE记录不同肿瘤组织的多个细胞系的多组学数据,可以观察基因在肿瘤细胞系的高低表达。
CCLE分析主要内容
>基因在各种肿瘤间的表达情况
>共表达分析
>功能分析
>GSEA富集分析
课时01.CCLE数据库课程简介【三味教育】.mp4
课时02.基因在各个肿瘤表达情况【三味教育】.mp4
课时03.CCLE数据下载【三味教育】.mp4
课时04.获取特定肿瘤矩阵数据【三味教育】.mp4
课时05.共表达分析【三味教育】.mp4
课时06.共表达热图绘制【三味教育】.mp4
课时07.基因名字转换为基因ID【三味教育】.mp4
课时08.GO富集分析【三味教育】.mp4
课时09.KEGG富集分析【三味教育】.mp4
课时10.GSEA软件和数据准备【三味教育】.mp4
课时11.GSEA运行和结果解读【三味教育】.mp4
生信分析数据挖掘CCLE数据库挖掘教学视频课程截图
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