生信分析数据挖掘CCLE数据库挖掘教学视频课程讲解目录


CCLE数据库

CCLE (Cancer Cell Line Encyclopedia),是Broad研究所与诺华研究基金会联合开发的在线数据库,

界面很简洁,直接输入你想查的Genes或者细胞系,就可以得到想要的信息。

CCLE记录不同肿瘤组织的多个细胞系的多组学数据,可以观察基因在肿瘤细胞系的高低表达。

CCLE分析主要内容

>基因在各种肿瘤间的表达情况

>共表达分析

>功能分析

>GSEA富集分析


课时01.CCLE数据库课程简介【三味教育】.mp4

课时02.基因在各个肿瘤表达情况【三味教育】.mp4

课时03.CCLE数据下载【三味教育】.mp4

课时04.获取特定肿瘤矩阵数据【三味教育】.mp4

课时05.共表达分析【三味教育】.mp4

课时06.共表达热图绘制【三味教育】.mp4

课时07.基因名字转换为基因ID【三味教育】.mp4

课时08.GO富集分析【三味教育】.mp4

课时09.KEGG富集分析【三味教育】.mp4

课时10.GSEA软件和数据准备【三味教育】.mp4

课时11.GSEA运行和结果解读【三味教育】.mp4


生信分析数据挖掘CCLE数据库挖掘教学视频课程截图


生信分析数据挖掘CCLE数据库挖掘教学视频课程CCLE数据库挖掘共表达热图绘制GO KEGG富集分析教程

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