生信分析环状RNA测序数据分析视频教程转录组学差异表达与功能分析课程

生信分析环状RNA测序数据分析视频教程讲解目录

环状RNA测序数据分析

主要内容

·环状RNA简介

·数据库准备和质控

·比对到基因组

·环状rna鉴定

. circBase注释

·差异表达

·功能分析

环状RNA

·环形RNA是mRNA在剪接的过程中，上游exon的5’端与下游exon的3’端剪接到一起，

从而形成的首尾相接的环状RNA分子。

circRNA特点

大多数定位于细胞质,且序列高度保守。比线性RNA更稳定,不易被降解。

许多circRNA表达水平与线性RNA的表达水平相当,一些circRNA的表达水平甚至超过它们的线性异构体10倍。

大多数来自蛋白质编码基因的外显子。

大部分是非编码RNA(noncoding RNA, ncRNA)。

环状RNA测序

RNA测序(RNA sequencing, RNA-seq)和生物信息学技术的快速发展,使大规模分析转录组数据成为可能。

三种建库类型

polyA尾抓取RNA

rRNA delete

RNase R处理

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环状RNA测序3_比对与环状RNA鉴定【三味教育】.avi

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circularRNA【三味教育】.zip

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