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GDSC数据分析

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GDSC数据库简介

抗癌药物敏感性基因组学(GDSC，Genomics of Drug Sensitivity in Cancer )由英国桑格研究院开发，

收集肿瘤细胞对药物的敏感度和反应。癌基因组的变异会影响临床治疗的效果，

不同的靶点对药物的反应也有很大不同。因此这类数据对于发现潜在的肿瘤治疗靶点十分重要。

GDSC数据库简介

GDSC的数据来自75000个实验，描述了约200个抗癌药物在1000多种肿瘤细胞中的反应。

该数据库中的癌基因组突变信息来自COSMIC数据库，包括癌基因点突变、基因扩增与丢失、组织类型以及表达谱等。

用户可以从化合物、癌基因和细胞系3个层面对数据库进行检索，癌基因或细胞系对不同药物的反应会被详细列出，

并且结果会以图形化的界面加以展示，包括统计分析，火山图及相关文献等。

检索结果以及整个数据库都可由用户下载以进行后续分析。

GDSC数据库简介

IC50(half maximal inhibitory concentration)，半数抑制浓度，是指被测量的拮抗剂的半抑制浓度。

它能指示某一药物或者物质(抑制剂)在抑制某些生物程序(或者是包含在此程序中的某些物质，

比如酶，细胞受体或是微生物)的半量。

在凋亡方面，可以理解为一定浓度的某种药物诱导肿瘤细胞凋亡50%，该浓度称为50%抑制浓度，

即凋亡细胞与全部细胞数之比等于50%时所对应的浓度，IC50值可以用来衡量药物诱导凋亡的能力，

即诱导能力越强，该数值越低，当然也可以反向说明某种细胞对药物的耐受程度。

课程资料【三味教育】

课时1GDSC数据库分析课程介绍【三味教育】 .pdf

课时2GDSC数据库简介【三味教育】.mp4

课时3GDSC数据库通过药物在线搜索操作【三味教育】.mp4

课时4GDSC数据库通过基因和细胞系搜索操作【三味教育】.mp4

课时5GDSC数据库数据下载【三味教育】.mp4

课时6GDSC数据库数据整理【三味教育】.mp4

课时7GDSC统计分析(基因)【三味教育】.mp4

课时8GDSC统计分析（药物)【三味教育】.mp4

课时9GDSC统计分析（指定肿瘤)【三味教育】.mp4

课时10GDSC统计分析绘图【三味教育】.mp4

GDSC4_download【三味教育】

GDSC5_arrange【三味教育】

GDSC6_geneCor【三味教育】

GDSC7_drugCor【三味教育】

GDSC8_cancer【三味教育】

GDsc9_corPlot【三味教育】

课件_GDSC数据分析【三味教育】 .pdf

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