从零开始做医学基础分析高通量测序生物信息分析视频教程讲解目录

课程介绍

1、生物DNA如何变成ATCG?

2、测序对生物样品有什么要求?

3、如何选择测序平台?

4、测序读长、文库大小对数据分析有何影响?

5、如何评价测序的好坏?

6、对于测序质量差的样品,该如何进行处理?

基因预测方法

1、利用软件对物种基因组直接进行预测;

2、是通过同源序列比对,和已知近源物种基因集进行比对,

将同源比对区筛选出来,作为基因。

比较方法

从头预测:不需要同源参考基因序列直接进行预测,非常方便,

适合于新发现的物种,没有很多已知的基因信息;

基于同源基因的序列比对:找出的基因则更加准确,但是如果没有同源序列,

或者同源区不含有某个基因的话,就会漏掉一些基因。


1-高通量测序生物信息分析【三味教育】

2-测序原理【三味教育】.mp4

8-fastq文件格式【三味教育】.mp4

25-构建scaffold【三味教育】.mp4

33-基因预测【三味教育】.mp4

52-NCBI数据【三味教育】.mp4

53-配套服务器的使用教程【三味教育】.mp4


2-生物数据分析软件【三味教育】

8-Linux环境配置及软件安装【三味教育】.mp4

10-如何学习生物数据分析【三味教育】.mp4

11-blast【三味教育】.mp4

12-blast应用【三味教育】.mp4

23-bwa【三味教育】.mp4

32-soapdenovo【三味教育】.mp4


3-perl语言入门与生物信息【三味教育】

2-perl语言编程环境【三味教育】.mp4

3-vim【三味教育】.mp4

19-统计fasta子程序【三味教育】.mp4


4-RNAseq生物信息分析【三味教育】

2-RNAseq测序技术概述【三味教育】.mp4

15-reads定位【三味教育】.mp4

23-基因表达量计算【三味教育】.mp4

27-cufflinks【三味教育】.mp4


5-16S测序生物信息分析【三味教育】

1-课程介绍【三味教育】.mp4

8-16S测序分析常用分析流程【三味教育】.mp4

9-16S测序分析常用数据库【三味教育】.mp4

26-OTU聚类pick_otus.py【三味教育】.mp4


6-Linux操作与生物信息【三味教育】

1-课程介绍【三味教育】.mp4

9-Shell与脚本【三味教育】.mp4

15-cd与ls 【三味教育】.mp4

26-vim高级技巧【三味教育】.mp4

39-文本排序sort【三味教育】.mp4

44-sed—波流(二)【三味教育】.mp4


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