临床医学科研生信分析ceRNA网络视频教程单基因套路单基因ceRNA调控网络含代码TCGA数据库生信自学视频教程课程

临床医学科研生信分析ceRNA网络视频教程讲解目录

内容提纲

第一章、TCGA数据库简介

第二章、软件安装

第三章、数据下载提取

第四章、差异分析

第五章、差异IncRNA与差异miRNA比对

第六章、DEmiRNA靶基因预测

第七章、网络构建数据准备

第八章、构建ceRNA网络

第九章、生存分析

1、TCGA数据库简介

美国政府发起的癌症和肿瘤基因图谱(Cancer Genome Atlas，TCGA）计划，试图通过应用基因组分析技术，

特别是采用大规模的基因组测序，将人类全部癌症(近期目标为50种包括亚型在内的肿瘤）的基因组变异图谱绘制出来，

并进行系统分析，旨在找到所有致癌和抑癌基因的微小变异，了解癌细胞发生、发展的机制，

在此基础上取得新的诊断和治疗方法，最后可以勾画出整个新型“预防癌症的策略”。

1TCGA数据库简介【三味教育】.mp4

2R安装【三味教育】.mp4

3perl安装【三味教育】.mp4

4cytoscape安装简单操作【三味教育】.mp4

5基因数据网页下载【三味教育】.mp4

6基因数据命令行下载【三味教育].mp4

7基因矩阵提取【三味教育】.mp4

8基因矩阵ID转换【三味教育】.mp4

9提取IncRNA和mRNA矩阵【三味教育】.mp4

10下载和提取miRNA矩阵【三味教育】.mp4

11差异mRNA【三味教育】.mp4

12差异lncRNA【三味教育】.mp4

13差异miRNA【三味教育】.mp4

14差异IncRNA差异miRNA比对1【三味教育】.mp4

15差异IncRNA与差异miRNA比对2【三味教育】.mp4

16DEmiRNA靶基因预测【三味教育】.mp4

17DElncRNA_DEmiRNA【三味教育】.mp4

18DEmiRNA_DEmRNA【三味教育】 .mp4

19厘性文件准备【三味教育】.mp4

18DEmiRNA_DEmRNA【三味教育】.mp4

19屈性文件准备【三味教育】.mp4

20Cytoscape导入数据和调整节点【三味教育】.mp4

21Cytoscape构建ceRNA网络【三味教育】.mp4

22生存分析数据准备【三味教育】.mp4

23DEIncRNA生存曲线【三味教育】.mp4

24DEmiRNA和DEmRNA生存曲线【三味教育】.mp4

lncRNA_miRNA【三味教育】.txt

miRNA_mRNA【三味教育】.txt

survival_lncRNA_mRNA_miRNA【三味教育】.xlsx

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