生信分析临床大数据挖掘ICGC数据库表达数据挖掘视频教程ROC曲线绘制热图制作课程

生信分析临床大数据挖掘ICGC数据库表达数据挖掘视频教程讲解目录

ICGC数据库表达数据挖掘主要内容

简介

数据下载

数据整理

差异表达分析

热图绘制

单基因KM生存分析

单因素COX分析

Lasso分析

多因素COX模型构建

生存分析和ROC曲线

风险曲线

独立预后因子

ICGC (lnternational Cancer Genome Consortium，国际肿瘤基因组协作组)，

主要目标是全面阐明导致全球人类疾病负担的多种癌症中存在的基因组变化。

ICGC收集了50种不同癌症类型(或亚型)的肿瘤数据，其中包括基因异常表达，

体细胞突变，表观遗传修饰，临床数据等。ICGC包括亚洲、

澳大利亚、欧洲、北美和南美17个行政区的89个项目，包括25,000个肿瘤基因组。

01.ICGC数据库简介【三味教育】.ts

02.ICGC数据下载【三味教育】.ts

03.ICGC数据整理【三味教育】.ts

04.差异表达分析【三味教育】.ts

05.热图绘制【三味教育】.ts

06.生存分析输入文件准备【三味教育】.ts

07.KM生存分析【三味教育】.ts

08.单因素COX分析【三味教育】.ts

09.lasso回归输入文件准备【三味教育】.ts

10.lasso回归【三味教育】.ts

11.多因素COX输入文件准备【三味教育】.ts

12.多因素COX模型构建【三味教育】.ts

13.风险生存曲线【三味教育】.ts

14.ROC曲线绘制【三味教育】.ts

15.风险曲线之热图【三味教育】.ts

16.风险曲线之风险值【三味教育】.ts

17.风险曲线之生存状态【三味教育】.ts

18.列线图绘制【三味教育】.ts

19.独立预后分析输入文件准备【三味教育】.ts

20.单因素独立预后分析【三味教育】.ts

21.多因素独立预后分析【三味教育】.ts

22.列线图【三味教育】.ts

67ICGcexp【三味教育】 .zip

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