临床医学科研生信分析数据库CPTAC蛋白质组数据库挖掘视频教程讲解目录


CPTAC蛋白质组数据库挖掘

课程内容

简介

CPTAC数据下载

数据补缺、矫正数据分组

差异分析

GO和KEGG富集分析

蛋白互作网络

批量化生存分析

批量化独立预后分析

批量化ROC曲线

批量化临床相关性分析

CPTAC数据库

蛋白质组是在一个细胞的整个生命过程中由基因组表达的以及表达后修饰的全部蛋白质。

蛋白质组学是指在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,

翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用。蛋白质组的研究不仅能为生命活动规律提供物质基础,

也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。

CPTAC(Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium ,

临床蛋白质组肿瘤分析协作组)整合了基因组和蛋白组的数据,

旨在识别和描述肿瘤组织和正常组织中的全部蛋白,发掘可作为肿瘤生物标记的候选蛋白。


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