医学大数据研究临床数据挖掘ICGC数据库SNP突变挖掘视频教程TMB生存分析肿瘤突变负荷计算课程

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ICGC数据库突变数据挖掘

主要内容

简介数据

下载数据

整理突变

矩阵瀑布图

突变位置可视化

突变和生存关系

突变负荷计算

突变负荷和生存关系

ICGC数据库

ICGC (International Cancer Genome Consortium，国际肿瘤基因组协作组)，

主要目标是全面阐明导致全球人类疾病负担的多种癌症中存在的基因组变化。

ICGC收集了50种不同癌症类型(或亚型)的肿瘤数据，其中包括基因异常表达，

体细胞突变，表观遗传修饰，临床数据等。

ICGC包括亚洲、澳大利亚、欧洲、北美和南美17个行政区的89个项目，

包括25,000个肿瘤基因组。

01.ICGC突变数据简介【三味教育】 .mp4

02.ICGC突变数据下载【三味教育】.mp4

03.基因注释【三味教育】.mp4

04.提取突变矩阵【三味教育】.mp4

05.暴布图输入文件准备【三味教育】.mp4

06.瀑布图绘制【三味教育】.mp4

07.添加染色体位值信息【三味教育】.mp4

08.突变位置可视化【三味教育】.mp4

09.生存分析输入文件准备【三味教育】.mp4

10.批量化生存分析【三味教育】.mp4

11.肿瘤突变负荷计算【三味教育】.mp4

12.TMB生存分析输入文件准备【三味教育】.mp4

13.TMB生存分析【三味教育】.mp4

ICGCsnp突变数据挖掘资料【三味教育】.zip

ICGC数据库突变数据挖掘.PPT.pdf

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