生信分析数据挖掘共表达方法预测IncRNA靶基因和功能视频课程讲解目录


共表达

共表达是基于基因间表达数据的相似性而构建的基因之间的关系,

具有相似表达谱的基因被连接起来形成网络。共表达网络从概念上来讲是简单直观的,

通过基因表达的相似性可分析基因产物可能的相互作用关系,从而了解基因间相互作用脉络。

We examined the expression correlation between prognostic IncRNAs 

and mRNAs bycalculating the Pearson correlation coefficient through paired lncRNA and mRNA

expression profiles in 419glioblastomapatients.A total of 931 protein-coding genes

 (PCGs)were expressed as highly correlated with at least one of IncRNAs contained 

in the six-lncRNA signature (Pearson correlation coefficient >0.5 and p <0.01).


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