生信分析数据挖掘临床医学科研生物信息学讲座视频教程

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多序列比对( multiple sequence alignment)是两个以上DNA序列,RNA序列或蛋白质序列的比对。

与双序列比对一样,多序列比对关心的是多个序列中哪些部分相似和哪些部分不同,

包括哪些部分发生了什么样的替换、插入和删除。

但有所不同的是,多序列比对能有效发掘多个序列中的相似性信息。

当两个序列不能很好地比对并由此揭示序列的变化所蕴含的意义时,

通过引入更多的序列,多序列比对可有效地使这两个原本难以直接比对的序列合理地关联起来。

其次,多序列比对常常用于分析种系距离很大的多个序列,揭示这些序列中保守的和非保守的区段、

保守区段的分布特征以及序列变化的进化趋势,这对于研究生物系统的进化是必不可少的。

再者,许多预测RNA和蛋白质结构与功能的算法立足于相应的多序列比对,

通过比较未知RNA和蛋白质的序列和已知RNA和蛋白质的序列预测未知RNA和蛋白质的结构与功能。

因此,多序列比对是基因组分析和蛋白质组分析的最常用手段之一

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