生信分析数据挖掘构建ceRNA共表达网络识别预后标志物视频教程GEO差异分析富集生存分析课程

生信分析数据挖掘构建ceRNA共表达网络识别预后标志物视频教程讲解目录

Part1:分析流程概述

Step1:研究背景

1急性髓性白血病(LAML) :

急性髓性白血病（LAML)，其特征在于骨髓祖细胞的异常增殖和分化，是侵袭性血液恶性

肿瘤。识别在造血祖细胞的调节中起重要作用的基因，有助于研究血液疾病的发病机制，

并且找到有助于LAML治疗的靶标。

2竞争性内源RNA(ceRNA):

RNA之间可以通过竞争结合共同的microRNA反应元件(MRE)实现相互调节，

这种调控模式构成竞争性内源RNA。

3加权基因共表达网络分析(WGCNA):

可以用来鉴定高度协同变化的基因集,并根据基因集的内连性和基因集

与表型之间的关联鉴定相关生物标记基因或治疗靶点。

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数据

AMLdiffSig.xls

AMLdiffSig_lncRNA.xls

AMLnormalizeExp.txt

cytoscape_network.txt

cytoscape_node.txt

edgerAML.xls

edgerAML_IncRNA.xls

gene_ENSG2Symbol.txt

GTE_IncRNA_Expression_count.txt

GTE_mRNA_Expression_count.txt

GTEx_Analysis_v8_Annotations_SampleAttributesDD.xlsx

GTEx_Analysis_vB_RNA_bloodr.tsv

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