临床医学科研数据挖掘联合多组转录组数据筛选癌症预后标志物视频教程生信套路分析课程

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联合多组转录组数据筛选癌症预后标志物课程目录

Part1:分析流程概述

Part2:数据获取及预处理

Part3:批次效应校正及效果评估

Part4:差异表达分析

Part5:生存相关基因的识别和验证

Part1:分析流程概述

Step1:研究背景

er结直肠癌

结直肠癌（ carcinoma of colon and rectum )是胃肠道中常见的恶性肿瘤，

早期症状不明显，其发病率和病死率在消化系统恶性肿瘤中仅次于胃癌、

食管癌和原发性肝癌。因此，识别结直肠癌的相关基因，对于治疗结直肠癌具有重要意义。

&批次效应

批次效应( batch effect )是由于实验条件不一致导致的。

批次效应在高通量测序项目中是普遍存在的。样本处理的背景条件不同，

RNA样本提取、建库、测序的条件不同（实验方法，操作人员等因素》等,

都会引入批次效应，最后导致与实验无关的误差被放大，降低了实验准确度。

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