生信分析数据挖掘TCGA数据库下裁差异分析生存分析视频课程miRNA差异表达教程

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TCGA数据分析主要内容

>TCGA数据库简介

>下载整理TCGA数据

>差异表达

>共表达网络

>生存分析

什么是TCGA?

美国政府发起的癌症和肿瘤基因图谱(Cancer Genome Atlas,..TCGA）计划，

试图通过应用基因组分析技术，特别是采用大规模的基因组测序，

将人类全部癌症て近期自标为50种包括亚型在丙的肿瘤）的基闪组变宾图谱绘制出来，

并进行系统分析，盲在找到所看致癌和抑癌基闲的微小变异,了解癌细胞发生、发展的机制，

在此基础上取得新的诊断和治疗方法，最后可以勾画出整个新型“预防癌症的策略”。

TCGA 使命:提高人们对癌症发病分子基础的科学认识及提高我们诊断、治疗和预防癌症的能力

TCGA目标:完成一套完整的与所有癌症基因组改变相关的“图谱”。

章节1-TCGA数据库数据下载整理【三味教育】

TCGA01--数据库简介.vc【三味教育】.mp4

TCGAO2--网页下载数据.ve【三味教育】.mp4

TCGA03--命令行下载数据.vc【三味教育】.mp4

TCGA04--生成矩阵.vc【三味教育】.mp4

TCGA05--id转换成基因名.vc【三味教育】.mp4

第一节(数据库课程简介)为免费视频【三味教育】.txt

章节2-TCGA数据库GENE差异表达分析【三味教育】

TCGA06--差异表达介绍.vc【三味教育】.mp4

TCGA07--edgeR差异表达.vc【三味教育】.mp4

TCGA08--DESeq差异表达.vc【三味教育】.mp4

章节3-TCGA数据库miRNA差异表达【三味教育】

TCGA09--miRNA数据下载与整理.vc【三味教育】.mp4

TCGA10--miRNA差异表达.vc【三味教育】.mp4

章节4-TCGA数据库共表达分析【三味教育】

TCGA11--共表达数据合并.vc【三味教育】.mp4

TCGA12--WGCNA.vc【三味教育】.mp4

章节5-TCGA数据做生存分析【三味教育】

TCGA13--生存分析介绍.vc【三味教育】.mp4

TCGA14--生存分析数据准备.vc【三味教育】 .mp4

TCGA15--R做生存分析.vc【三味教育】.mp4

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