临床医学生信分析数据挖掘TCGA数据库肿瘤微环境视频教程免疫细胞分组差异分析热图绘制课程

临床医学生信分析数据挖掘TCGA数据库肿瘤微环境视频教程讲解目录

肿瘤微环境课程主要内容

简介

表达数据下载

数据整理

肿瘤微环境分析(免疫和基质评分)

临床数据下载和整理

评分和生存关系

评分和l临床性状关系

差异分析

差异热图

GO富集分析

KEGG富集分析

基因生存分析

蛋白互作网络分析

肿瘤微环境是肿瘤细胞所处的细胞环境，其组成包括细胞外基质、

可溶性分子和肿瘤基质细胞。肿瘤微环境一旦形成，众多免疫细胞，

如T细胞、髓源抑制性细胞，巨噬细胞等，都被趋化至此，构成肿瘤的微环境。

在肿瘤微环境中，免疫细胞和基质细胞是两种主要类型的非肿瘤组分，

并且已被提出对于肿瘤的诊断和预后评估具有价值的。

01肿瘤微环境简介【三味教育】 .mp4

02表达数据下载【三味教育】.mp4

03数据整理成表达矩阵【三味教育】.mp4

04 id转换成基因名【三味教育】.mp4

05肿瘤微环境细胞score【三味教育】.mp4

06 l临床数据下载【三味教育】.mp4

07临床数据提取【三味教育】.mp4

08评分和生存关系第—部分【三味教育】.mp4

09评分和生存关系第二部分【三味教育】.mp4

10评分和临床关系第一部分【三味教育】.mp4

11评分和临床关系第二部分【三味教育】.mp4

12基质细胞分组差异分析【三味教育】.mp4

13基质细胞分组热图绘制【三味教育】.mp4

14免疫细胞分组差异分析【三味教育】.mp4

15免疫细胞分组热图绘制【三味教育】.mp4

16差异交集和Venny图绘制【三味教育】.mp4

17基因名称转换成基因id【三味教育】.mp4

18Go富集分析【三味教育】.mp4

19 KEGG富集分析【三味教育】.mp4

20蛋白互作网络构建【三味教育】.mp4

21蛋白互作网络构建第二部分【三味教育】.mp4

22批量化生存分析文件准备【三味教育】.mp4

23批量化生存分析【三味教育】.mp4

TCGA肿瘤微环境【三味教育】.zip

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