生信分析数据挖掘ceRNA调控网络构建TCGA数据库视频教程讲解目录
TCGA数据厍简介
美国政府发起的癌症和肿瘤基因图谱(Cancer Genome Atlas,TCGA)计划,
试图通过应用基因组分析技术,特别是采用大规模的基因组测序,
将人类全部癌症(近期目标为50种包括亚型在内的肿瘤)的基因组变异图谱绘制出来,
并进行系统分析,旨在找到所有致癌和抑癌基因的微小变异,了解癌细胞发生、发展的机制,
在此基础上取得新的诊断和治疗方法,最后可以勾画出整个新型“预防癌症的策略”。
TCGA数据库包括丰富的数据类型和肿瘤类型,不需要任何费用即可获得大量数据,
其次在TCGA下载的数据已经经过了前期繁琐的标准化处理,节省了人工处理时间和资源。
课程内容提纲
第一章、TCGA数据库简介
第二章、软件安装
第三章、数据下载提取
第四章、差异分析
第五章、差异lIncRNA与差异miRNA比对
第六章、DEmiRNA靶基因预测
第七章、网络构建数据准备
第八章、构建ceRNA网络
第九章、生存分析
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