临床医学生物信息学基础入门相关数据库及软件的应用视频教程讲解目录


基因组变异数据库(突变、SNP、插入、缺失、拷贝)

癌症相关基因数据库(促癌、抑癌基因、转移相关基因)

癌症基因表达数据库(利用基因芯片、测序检测等技术检测基因在各癌症的表达情况、差异表达分析)

癌症表观遗传修饰数据库(DNA甲基化、表观遗传修饰)

非编码RNA(癌症相关miRNAs,circRNAs,IncRNAs等)

癌症调节网络关系数据库(癌症基因间的调节关系)

癌症大规模数据储存、分析平台(癌症相关高通量数据的查询、访问及分析)

癌症基因表达数据库

Cancer RNA-seq Nexus:来自GEO数据库和TCGA数据库中癌症相关RNA-seq处理的差异表达基因,http://syslab4.nchu.edu.tw/

Expression Atlas:不同条件下(包括癌症)基因表达情况数据库,https://www.ebi.ac.uk/gxa/home

.Oncomine:大型肿瘤基因芯片数据库,提供基因在癌症的表达信息、差异分析和工标的分析,www.oncomine.org

GEPIA:基因在癌症的表达信息、生存分析( TCGA来源的数据),http://gepia.cancer-pku.cn/


1生物信息学研究发展.【三味教育】.mp4

2常用生物医学数据库介绍及实操演示(NCBl).[三味教育】.mp4

3常用生物医学数据库介绍及实操演示(UCSc)【三味教育】.mp4

4癌症相关数据库概况.【三味教育】.mp4

5 TCGA数据库的介绍及使用.【三味教育】.mp4

6 TCGA数据的在线分析.【三味教育】.mp4

7基因本体数据库GO及注释.【三味教育】.mp4

8生物学通路KEEG、注释及基因功能富集分析.【三味教育】.mp4

9蛋白互作、转录因子条件关系数据库的介绍和使用.【三味教育】 .mp4

10转录因子调节关系.【三味教育】.mp4

11基因网络图的展示、Cytoscape软件的介绍和使用.【三味教育】 .mp4

12实例讲解GEO数据库下载、处理和分析【上】【三味教育】 .mp4

13实例讲解GEO数据库下裁、处理和分析【下】【三味教育】 .mp4

14实例讲解TCGA数据的下裁、处理和分析【三味教育】.mp4

癌症相关数据库(第二讲)【三味教育】 .pdf

常用生物信息学数据库(第一讲)【三味教育】.pdf

第四讲调节网络【三味教育】.pdf

基因功能富集分析(第三讲)【三味教育】 .pdf

基于公共数据库进行课题研究的案例分析(第五讲)【三味教育】 .pdf


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临床医学生物信息学基础入门相关数据库及软件的应用视频教程生物学通路KEEG数据库TCGA课程

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