生信分析GEO数据库免疫细胞浸润视频教程生信自学网CIBERSORT小提琴图成对差异图主成分分析GEO数据库单基因免疫细胞浸润分析课程

生信分析GEO数据库免疫细胞浸润视频教程讲解目录

GEO免疫细胞浸润模式

课程内容

简介

数据下载

探针转换成基因名

数据矫正

CIBERSORT

筛选样品柱状图热图

相关性热图

小提琴图

成对差异图

主成分分析

免疫细胞浸润

免疫细胞浸润是指免疫细胞从血液中移向组织，开始发挥它的作用，

可以从组织中分离出的浸润免疫细胞。肿瘤中免疫细胞的浸润与临床结果密切相关，

肿瘤中浸润的免疫细胞最有可能作为药物靶标来提高患者的生存率。

预测软件

CIBERSORT，是由Bindea G等开发的反卷积算法，

可以基于标准化的基因表达数据来估算复杂组织的细胞组成，该方法能量化特定细胞类型的丰度。

通过流式细胞分选术很好地验证CIBERSORT能准确预测免疫细胞的组成。

课程01 GEO兔疫细胞浸润简介【三味教育】.mp4

课程03探针矩阵转换成基因矩阵【三味教育】.mp4

课程04样品分组整理【三味教育】.mp4

课程08绘制柱状图【三味教育】.mp4

课程09绘制热图【三味教育】.mp4

课程10绘制相关性图【三味教育】.mp4

课程11绘制小提琴图【三味教育】.mp4

课程12绘制成对差异图【三味教育】.mp4

课时02GEO数据下载【三味教育】.mp4

课时05数据矫正【三味教育】.mp4

课时06获得免疫细胞矩阵【三味教育】.mp4

课时07免疫细胞矩阵过滤【三味教育】.mp4

课时13 PCA主成分分析【三味教育】.mp4

60GEOimmune免疫细胞浸润模式资料【三味教育】.zip

GEO数据库免疫细胞浸润(生信自学网)更新地址【三味教育】.txt

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