生物信息库数据分析GSVA基因集变异分析视频教程安装代码Gene Set Variation Analysis通路矩阵课程

生物信息库数据分析GSVA基因集变异分析视频教程讲解目录

GSVA

基因集变异分析（Gene Set Variation Analysis，GSVA) ，

一种以非监督方式对一个简单群体评估通路活性变异的GSE方法。

GSE基因集富集(gene set enrichment）方法通常被认为是一个生物信息学分析的终点，

但是GSVA构成了一个构建以通路为中心的生物学模型的起点。

GSVA与其它工具的区别

>David和kobas等分析工具(先找差异基因)

>GSEA(无需先找差异基因)

GSEA计算的基本原理是扫描排序序列，当出现一个功能基因集中的基因时，

就增加ES值，反之，就减少ES值，所以在整个扫描过程中，

ES是一个动态的值。>GSVA(无需先找差异基因)

基因矩阵转换成基因集矩阵。

2.1【三味教育】.mp4

GSVA基因集变异分析.pdf

c2cp.kegg.v6.2.symbols.gmt

c5.all.v6.2.symbols.gmt

c2.cp.kegg.v6.2.symbols.gmt

c5.all.v6.2.symbols.gmt

GSVA.R

gsvaOut.txt

input.txt

all.txt

diff.R

diff.xls

gsvaOut.txt

heatmap.txt

heatmap.tiff

heatmap.txt

pheatmap.R

生物信息库数据分析GSVA基因集变异分析视频教程截图