生信分析数据挖掘生物信息学常用数据库COSMIC数据库癌症分析视频教程曼哈顿图绘制基因突变卡方检验课程

生信分析数据挖掘生物信息学常用数据库COSMIC数据库癌症分析视频教程讲解目录

COSMIC数据库挖掘

主要内容

数据库简介

网页操作

数据下载

提取相应肿瘤数据

突变位点统计

临床数据分组

基因突变差异

位点突变差异

manhattan图绘制

coSMIC数据库

COSMIC记录癌症相关的体细胞突变信息，这个数据库对于突变位点的信息记录较为详细，

包括文献出处、样品名称、组织类型、涉及到的癌症种类和具体的突变内容，

这个库既有对某一基因突变现象的综合统计，

也对某一肿瘤组织或癌症细胞系的所有突变信息统计。

学员需求

已知基因，希望了解基因在各个癌症中的突变情况

已知肿瘤，希望了解肿瘤中哪些基因突变频率高已知肿瘤，

希望了解肿瘤中哪些位点突变频率高

按临床分组，希望了解不同组之间突变差异

课时01.COSMIC数据简介【三味教育】.flv

课时02.网页操作搜索基因【三味教育】 .flv

课时03.网页操作肿瘤【三味教育】.flv

课时04.COSMIC数据下载【三味教育】.flv

课时05.提取相应癌症的突变数据【三味教育】.mp4

课时06.提取相应癌症的样品信息【三味教育】.mp4

课时07.突变位点统计【三味教育】.mp4

课时08.突变位点统计柱状图【三味教育】.mp4

课时09.基因卡方检验输入文件准备【三味教育】.mp4

课时10.基因突变卡方检验【三味教育】.mp4

课时11.位点卡方检验输入文件准备【三味教育]】.mp4

课时12.位点突变卡方检验【三味教育】.mp4

课时13.曼哈顿图输入文件准备【三味教育】.mp4

课时14.曼哈顿图绘制【三味教育】.mp4

COSMIC【三味教育】.zip

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