生信分析临床医学科研实用生物信息技术GSEA操作视频教程讲解目录
富集分析应用实例
这里以目前应用较为广泛的DAVID为例对基因集进行具体分析。
DAVID是一个综合工具,不但提供基因富集分析,
还提供基因间D的转换、基因功能的分类等。
当前基于GO或KEGG的基因功能预测策略
首先,从总体上宏观地概括抽取信息,如不同样本间、不同时间点间全部差异基因;
其次,通过GO或KEGG分析,即从GO分类结果找到实验涉及的显著功能类别或将差异基因映射到通路中,
根据基因在通路中的位置及表达水平的变化算出受影响显著的通路,从而预测未知的基因功能等。
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